Qualification des listes floristiques

Qualification des listes floristiques

fibdl_listflor_qualify(
  data,
  seuil_nbr_valves = 350,
  seuil_pour_valves_sp = 0.5,
  seuil_pour_taxons_indiciels = 0.75,
  table_tax_alerts = IBDL:::Table_taxons_alertes
)

Arguments

data

tableau representant la liste floristique

seuil_nbr_valves

nombre de valves compte dans le prelevement. Dans la norme, il est demande de compter 400 valves.

seuil_pour_valves_sp

seuil en pourcentage de valves determinees au rang taxonomique espece dans le prelevement. Petite specificite, on ne prend pas compte le code taxon ADMI (complexe taxonomique).

seuil_pour_taxons_indiciels

seuil en pourcentage des taxons indiciels dans le prelevement

table_tax_alerts

tableau de reference au format binaire des taxons d'alertes et indiciels, par defaut Table_taxons_alertes (table interne embarquee)

Value

tableau avec les informations liees au prelevement. La colonne validation renseigne la selection finale.

Examples

list_flor <- read.csv2(system.file("listflor.csv", package = "IBDL"),fileEncoding = "utf-8") %>%
IBDL::fibdl_listflor_transcode()
fibdl_listflor_qualify(data=list_flor)
#> $table_validation
#> # A tibble: 7 × 8
#>   id_prelevement   tot r_esp r_ADMI Ab_tot_indiciel pour_taxons_indiciels
#>            <int> <int> <lgl>  <dbl>           <int>                 <dbl>
#> 1            314   402 TRUE   0.993             398                 0.990
#> 2            315   402 FALSE  0.978             115                 0.286
#> 3            316   402 TRUE   0.973             402                 1    
#> 4            317   400 TRUE   1                 400                 1    
#> 5            318   408 TRUE   0.983             315                 0.772
#> 6            319   401 TRUE   0.995             328                 0.818
#> 7            320   408 TRUE   0.998             224                 0.549
#> # ℹ 2 more variables: nbr_valves <lgl>, Validation <lgl>
#> 
#> $id_prelevement_admi
#> integer(0)
#>